Ekern ist ein Ortsteil der Gemeinde Bad Zwischenahn im niedersächsischem Landkreis Ammerland. Es liegt südlich von Bad Zwischenahn, an der Grenze zur Nachbargemeinde Edewecht.
Zur Bauerschaft gehören neben Ekern selbst noch Burgfelde und Aschwege.
Die Ortsnamen Ekern, Aschwege und Querenstede werden erstmals 1270 im Lehnsregister der Grafen von Oldenburg und Bruchhausen erwähnt.
Um 1295 wurde in der sumpfigen Aueniederung die Scusselsburg gebaut. Die heutigen Ortsbezeichnungen Burgfelde und Borgwisch sind auf den Standort der Scusselsburg zurückzuführen
1865 hielt der technische Fortschritt mit dem Bau der Ekerner Mühle seinen Einzug.
Verbesserungen kamen durch den Straßenausbau. 1912 erfolgte der Bahnanschluss mit eigenem Bahnhof.
Die Landwirtschaft wurde durch das Aufkommen von Dreschmaschinen, Lokomobilen und später Traktoren schneller und einfacher. Dies alles bewirkte ein Aufblühen der Wirtschaft. Vor allem in der modernen Ziegelei von Lüers entstanden neue Arbeitsplätze.
Bis 1945 blieb Ekern bis auf einen Bombennotabwurf von Kriegshandlungen verschont. Die Ekerner Mühle wurde stark beschädigt und war nur noch ein Torso ohne Kappe, blieb aber als Motor-Mühle bis 1963 in Betrieb.
Ab 1962 wurde die Volksschule als Grundschule mit den Jahrgängen 1–4 weitergeführt und mit Ratsbeschluss vom 16. Juni 1970 komplett geschlossen und beherbergt seitdem örtliche Vereine.
1964 erfolgte der Anschluss an die öffentliche Wasserversorgung und in den Jahren 1985 bis 1987 der Anschluss an die Zwischenahner Kanalisation
Ab den 1970er Jahren begann die Ansiedelung großflächiger Industriebetriebe. 1972 Ziegelei Röben; 1993 Kunststoffwerk Oltmanns (heute Pipelife); 1997 Gewerbegebiet „Hahnenkamp“
Ekern blieb jedoch weiterhin ländlich und von Baumschulwirtschaft geprägt.
1991 endete der Kleinbahnbetrieb, dessen Trasse 1994 für Fahrradtouristen hergerichtet wurde.
In den Jahren 1996 bis 1999 wurde die Ekerner Mühle aufwendig saniert und erhielt ihre alte Kappe mit den Flügeln wieder.
Als Industrie hat sich in Ekern vor allem die Ziegelindustrie etabliert, da man hier auf umfangreiche Tonvorkommen zugreifen konnte.
Einwohnerzahlen in Ekern mit Stand 31.12.2022 : 1.300